ENST00000478315.5, ENST00000478315.5 (transcript) Homo sapiens

Feature
Overview
NameENST00000478315.5
Unique NameENST00000478315.5
Typetranscript
OrganismHomo sapiens (Human)
Sequence length693
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
chr9chromosomechr9:4118745..4147644 -
Analyses
This transcript is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
FASTA Sequence - Transcripts2017-03-29
FASTA Sequence - Protein Coding Transcripts2017-03-29
Gencode Annotation2017-03-01
Properties
Property NameValue
Gene idENSG00000107249.21
Transcript idENST00000478315.5
Gene typeprotein_coding
Gene nameGLIS3
Transcript typeprotein_coding
Transcript nameGLIS3-015
Level2
Protein idENSP00000418995.1
Transcript support level1
Tagalternative_5_UTR
TagmRNA_end_NF
Tagcds_end_NF
Havana geneOTTHUMG00000019463.5
Havana transcriptOTTHUMT00000354783.1
Relationships

This transcript is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
ENSG00000107249.21ENSG00000107249.21Homo sapiensgene


The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ENST00000478315.5ENST00000478315.5-proteinHomo sapienspolypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this transcript:

Feature NameUnique NameSpeciesType
UTR5:ENST00000478315.5UTR5:ENST00000478315.5Homo sapiensfive_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Feature NameUnique NameSpeciesType
exon:ENST00000478315.5:3exon:ENST00000478315.5:3Homo sapiensexon
exon:ENST00000478315.5:2exon:ENST00000478315.5:2Homo sapiensexon
exon:ENST00000478315.5:1exon:ENST00000478315.5:1Homo sapiensexon


The following start_codon feature(s) are a part of this transcript:

Feature NameUnique NameSpeciesType
start_codon:ENST00000478315.5start_codon:ENST00000478315.5Homo sapiensstart_codon


The following CDS feature(s) are a part of this transcript:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CDS:ENST00000478315.5CDS:ENST00000478315.5Homo sapiensCDS


Sequences
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>ENST00000478315.5 ID=ENST00000478315.5|Name=ENST00000478315.5|organism=Homo sapiens|type=transcript|length=693bp
CATTTGTCAGATGCTTTCCTCTCTGCACTCCAGCCTTTGCTGAATGTCCT
GGCAGTTCCTGAATGTTCCTGCTGCCTGCATTTTATAAAACCAAAGAGCA
AGTAGCCCTGGAAATGTATGCCAAGTACTCTGCACAGCTGTCTGAGGCCC
CCAGCCAAGGGCAAGATATAAACAATCTATACCCACACAGGTACACAAGC
AGACACTGCATATGGAAGCCCCGCAGTGCAAGGACTTCTTACTTCTAACA
CTTTAAAATGTCAGTGGCCAAACAGCCTGAGAACATGAATAATTTAAGCA
TGAGATGCTTTTGCTGATGATTTTGATCATTTTTCAGGAAGAATAATGGG
GCTCTTGGCTTTGGGCCTCAGTGCAAGTCCATTGGAAAAGGCAGCTGCAA
CAATCTAGTGGTCACCAGCAGTCCCATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCA
TTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTACAGCATGCAACCAGATCAGTCCT
AGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGA
TACCAGGTCCCTTATTTCGCGTGAGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTC
TGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGCATGAAGCAGGAGTGGTCCCAGGGC
TACAGGGCCCTCCCTTCGCTCTCCAACCACGGCTCTCAGAATG
back to top

transcript from alignment at chr9:4118745..4147644-

Legend: five_prime_UTRexonstart_codonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ENST00000478315.5 ID=ENST00000478315.5|Name=ENST00000478315.5|organism=Homo sapiens|type=transcript|length=28900bp|location=Sequence derived from alignment at chr9:4118745..4147644- (Homo sapiens)
CATTTGTCAGATGCTTTCCTCTCTGCACTCCAGCCTTTGCTGAATGTCCT GGCAGTTCCTGAATGTTCCTGCTGCCTGCATTTTATAAAACCAAAGAGCA AGTAGCCCTGGAAATGTATGCCAAGTACTCTGCACAGCTGTCTGAGGCCC CCAGCCAAGGGCAAGATATAAACAATCTATACCCACACAGGTACACAAGC AGACACTGCATATGGAAGCCCCGCAGTGCAAGGACTTCTTACTTCTAACA CTTTAAAATGTCAGTGGCCAAACAGCCTGAGAACATGAATAATTTAAGCA TGAGATGCTTTTGCTGATGATTTTGATCATTTTTCAGGAAGAATAATGGT AAGAAATTTGTTAAGAAATTCCAAATTGAAATTCCATTATTGAAATTCCA ATAATAGAATGGAGGTACGTGAAGGAAGAGGACTAGGAATTTTAGAATTT GTATTTGCTGTAAGAAATTAAAATATAGTATGACGTTGAACTTTCAGAAC TTCTTAGGATATTGCCTGCATAATGTTCAATTTGGGGAAGAAATGAATGG CCAGAGGAGATTAATTGCAGTGGGCTTAAATTTCTAAATGTCAGGTGCTA GGTCAGGGTGGCTAGAAAATTAGAGGCATACGGTGAAATGCCTTTAATTT GGTATAAGATCTAGTGCATTTGACTCTAAAGATGCTTTGGGACAATCAAA TTGAGAAATAATAGCAAGATAGTTTTTAAAAGTCGAACGTAATACTCTTC AGAATGAGTGTCAAATAAAATCCAGTACATTGGTTCTGGCCTGTTTTAAA TGAATAGCTCTTGTAGCATCCTTCCTCTTTGCTGTGTTTATCTAGAGAAC TGTTTAATTTTTATTAGTAGGCTAATTCTTGCATTAAAGACATAAATTGC ATATTTAGGATGGAGAATAGGCGTTTGAGATGAAGTTTATTCAGGGTTCT GTCCCTACTGCTGAAAAATCTAATTCACTGCTGAGTGGATCGTAACTGCA GTTGCTAATTTAAAAATCAGTTCGCCAGATTCCAGTGACTTTGATAAGAC TTTTATTCTTTTCAATCTTATGTATTTGTGAGCACATACTTGGGAAGATT GCTGCTGAGTAGTGTTGCATGTCAGAGATGAGGACAGTTTAGTCATTAAC CCTAAATTGAGGGTAAAGACTGGCAATAGGCAGCCTGTGGAATGAGGAAA GGGCCAAGTTGAAATATTTCCAAAAGGTATTTTTGTTGTTTACCCTTGTT AATTATTAATACTAATTATTGATGAAAAATAGTTTTGAGTTACATGCCAC ACATTGTTTAGGAATAAATTATCAAATTTCTTATCTAGAACTATAGTAGA TATTCAACGGTTTCAAATAATCGATATTTATTAAGTTAGTAAGGTGTCCC CCCTTCCTTCAACATTAAAGACACAAATCCATAAAGTTCTGGTGCATAAA GACTTTGTTTCATGAAAGTGCACTTTCCTCCCAGCTTTGGGTAGCTTCTT GCACTAAATGAATATGTTAAGAACTGAATTTGACAAAATCAGGTCAATAA TTAAAAAGTATCTTTAGAACAAAGTACCTATCTCATGTAAGACATGTAGA TAATATATAGGTTTTATAGGTTAAAATTGCCAAATTAGTTATGAATGTTG TGCTTTGTCTCAATTGTCCATGCCTTTTCAGATTTGTACTTTTTTGTCAT GTTAGTTTCTTGGAAATGACCTTTTTAGGAATTTCTATATTTTGTAGTTT ATCATACAGGCTTAAATGAAGTATATTGTTTAAATTCTACTGAGCGGGTA TGCACTTCCCAGAGAAGATTACTCTCTCTGGGAGTCAGAACTGGCTGATA CTAAAGGAGAGAGAGGGAGAGAAAGGGAGAAAGTGAGGGAGGGAGGGGGA 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CAGAAATGCTTACATTACTCTAGTTCTCTTATAAGTTAAAAAATAGCATT AAATAAAAGAAACAGAAGGGAATTACATTATGTAGGCCTCAGCCAGATTG CCTGTGTGTTGAGATTTGTGATGTTAAAATTGTATTTTTATATTTTGGTA TTTTAGTTAAAGTTATGTGATTTTATACAATGACAAATTTTCTGAGCCAA AAGGTAGATATTTCAGCCTTCCTACCTCTCCAATTTTCAGCAAATCTGTA GTATGACTTATTCTACCAATTTATGTATACAAGAAATGGTTGTTTAAATT ATTTCCTTTAAATCACAACAAATCAGATGCCAAGATTCCATCTTACTCAT TAGTGGGAAATTTAATCTCAGTTATTGCTAGTTGGGGTGGCCTGATACAC TACCAAGGTGACACAGAATCCCAGGGTGTTTGTAGAGAGCAGAACATTCC AGGAGCTTTTCTGTGTTCTTGGTTCTTCAGGTTACTGCTGAGATGCCCTT TGACCAAGCCCCACATAGCCTCTAGGAGTCTGCTGCTCTGTGCATTGCTT GGACACAGGAGGTTTTGCTGGAGCTGGGAGCCCAGGCCCGAAGGTCTGGC CTTTGTATTTTGGCCAGGCAGCCATACCTTTTACCCCCACTGCCTTCCTT GGGAGCTGTCTTGCTACTCAGGGACCATCAAACTGTTGTTCTTCCCAGAC TTTGGGCAATCCCACCTCTCTCTCTCCTTCTGTCTCCCTCCTAGAGGCAC TATCCTCTTTCAGAAGGCTCTGCCACCTTCAGAGCACCTGGAATAATCTC AGTGAATTTAGATTTCTACACAAGACTGTGAGAGAGGATGAATTTGGCCA GGCACGGTGGCTCACACCTATAATCTCTGAACTTTGGGAGGACGAGGAGG GTGGATCACCTGAGGTGAGGAGTTCGAGACCAGCCTGTCCAACATGATGA 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TAAGATAAGTTGGGCTTTACCCTGTTTGCTCCGTTTGCTCTTCCCAGCCT GGTCTCACCCTGAGATTATGGCAACATCTTACTAGCTTGGTTTCCTGCCT TCAGCCTTTGCTCTGCTTCTAAATGTACTGGAAATAGACTGTTATCTTCT TGCTCCCTCCTTACAACATACCCATGCTTGCAAGTCTACTGTAGCTCTTT GGGGTGCCTGGTTTTGGAGGTTGTGTGCAATCTGATAACATCTTAGTAAG AATATGAATGCCTACAGCTTATAGAGTACTTACTGTGTGCTGGAAACTGT TGTAAGTGGTCTACATACGTGACTTATTTCATACTCCAAACAGCCTTATG AAGGTGGGAACAATTATCATCCCCATTTCCCAGACAAGGAAATAGAGGCA CAGAGAGCTTAAGGCATTTGCCCAAGGTCACACAGCTGGTAAGGGAAGCT ATTCTGGCCCTAGTGTCTCATTCTTTACGGCTTCCCCCATGCTGCCTCCA TAATACTTCCTCAGCACATGCACCTCACTTCATTTTGGCCATCCAACTCT TCATATTGCCCCCTCTCCTCCTGCCATTAAAAGGCTCAGATGAAGTCTCA CTCCTCTACTAAGCCTCCTCCAGTGTATTCAGATCTTTTCCTCATTTGAG CTCTTTTTGTACTCAGCAGTGAAGCAACTCAATTTAAGATTAGGTGTTTG CCAATTGTTTCCTGTGTTAGTTAACACTCTCTCCAATTGGTTGTAAGATC TTTGACCAAGGGCTAGCTGTACGGCCTAGGACCAAGCCTAACACCCAGTA AATGTGTCTTTGGGAAACTGAGGCAGTTTTCTCCCATGACAATATGCGTT CTCCCTCCCTTCCATTCATTCTTTCTTATATTTGTGGAAGTCCTCTTTTT CCACAGTAAGTATAATAATTCCACTTTTATATATTTTCACAGATGTGTCC 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Coding sequence (CDS) from alignment at chr9:4118745..4147644-

>ENST00000478315.5 ID=ENST00000478315.5|Name=ENST00000478315.5|organism=Homo sapiens|type=CDS|length=536bp|location=Sequence derived from alignment at chr9:4118745..4147644- (Homo sapiens)
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